FMA : le film est la suite de l'anime Full Métal Alchimiste et reprend là où il en était resté.
Edward et Alphonse se retrouvent chacun d'un côté de la "Porte" et cherchent à se retrouver pour savoir si l'un et l'autre vont bien et si la transmutation finale d'Edward a fonctionné.
Alphonse ne se souvient de rien en ce qui concerne toutes les aventures vécues avec son frère : la pierre philosophale, les homoncules, etc... Mais il a repris ses études d'alchimie, plus motivé que jamais.
Edward, lui, doit survivre dans un contexte de l'Entre Deux Guerres à Munich, aidant une jeune bohémienne, Noah, qui peut lire à travers lui et découvrir le monde de l'alchimie.
Mais l'affaire se complique : dans le monde d'Edward, il n'est pas le seul à vouloir passer de l'autre côté de la porte...
L'histoire se passe deux ans après la fin de la série, à Munich (en Allemagne), en 1923.
Après la première guerre mondiale, c'est une Allemagne appauvrie et faible. Les Juifs luttent contre les Nazis.
Ed est coincé dans ce monde, sans alchimie, sans espoir de sortir. Il rêve de retrouver son frère dans le monde de l'alchimie, et pour cela il fait des recherches en fuséologie. Mais ses maigres espoirs s'écroulent rapidement.
Un nouveau compagnon, du nom d'Alphonse Heiderich est à ses côtés, et ressemble étrangement à Al. Alphonse Heiderich fait également des recherches en fuséologie, c'est d'ailleurs pour ça qu'ils se sont rencontrés, et Alphonse a décidé d'aider Ed à retourner dans son vrai monde, qu'il soit réel ou non...
Alphonse Elric, lui, après avoir retrouvé son corps humain, ne se souvient toujours pas des moments passés avec son frère ainé. Mais il demande souvent des renseignements sur lui, et a décidé de le rechercher. Il a beaucoup progressé en alchimie et ressemble beaucoup, physiquement, à son frère.
Ed trouvera-t-il comment retourner dans son monde ? Ou restera-t-il coincé dans celui-ci ? Chaque seconde qui passe dans ce monde lui fait perdre de plus en plus espoir de retourner auprès des siens ...
